Está claro que para ejecutar un programa con salida gráfica basta con:

ssh -X servidor comando

Pero que pasa cuando queremos ejecutar todo el desktop en una ventana, al estilo Reflection-X o XWin-32. Para eso tenemos el comando Xnest, que se ejecuta así:

Xnest :3 -query servidor

El :3 es un ID de display, podemos poner cualquiera que este libre, en mi caso el 0, 1y 2 están ocupados, así que va 3.